华软学院严格按照国家的法律制度制定财务管理制度，学费收入主要用于学校的基本建设、举办各种专业的学术研讨活动、开展教学科研实验和支付教职员工的工资福利。
　　学院的年度财务审计工作是由广东省财政厅、广东省工商行政管理局认证的广东正中珠江会计师事务所负责。该所是广东本土最高资质的注册会计师事务所，共有注册会计师78人，并拥有丰富实践经验的会计、审计、税务、金融、管理、法律、评估、计算机及工程技术各类专业人才，在广东地区会计师事务所中名列前茅。审计客户涉及金融、制造、交通、高科技、水力电力、商业、饮食、房地产、教育等行业，具有很高的资质和知名度。每年的1月至4月，由广东正中珠江会计师事务所对华软学院去年1月1日至12月31日全年的财务收支情况的合法性进行审计。
　　审计范围包括： 财务管理制度、资金运作制度、资金收支帐务、 流动资产和固定资产管理。实行全面的财务审计，使学院的资金得到合理的运用和合法的监控。